Opis zadania

Każde z zadań opisywane jest przy pomocy wykonywalnego pliku tekstowego zawierającego dyrektywy QCG.

Dyrektywy QCG mają charakter informacyjny dla systemu i dostarczają informacji jak przygotować środowisko wykonania dla danego zadania (pliki wejściowe/wyjściowe) oraz jakie są prefrencje/wymagania zasobowe.

Najprostszym plikiem zadania jest plik zawierający tylko informacje jak uruchomić daną aplikację:

#!/bin/bash

date

W większości przypadków zadanie wymaga przekazanie do systemu dodatkowych informacji dotyczących konfiguracji środowiska wykonawczego bądź wymagań zasobowych.

Przekazanie tych informacji polega na umieszczeniu w pliku odpowiednich dyrektyw. Dyrektywy zaczynają się od sekwencji "#QCG", po ktorej następuje nazwa dyrektywy i opcjonalne parametry.

Najczęsciej wykorzystywane dyrektywy

• host - wybór klastra dla zadania
• grant - grant w ramach którego ma być wykonane zadnie
• output / error - standardowe strumienie wyjścia / błędów
• procs / nodes - wymagania co do ilości rdzeni i węzłów
• queue - wybór kolejki
• stage-in-file / stage-in-dir - kopiowanie plików / katalogów wejściowych
• stage-out-file / stage-out-dir - kopiowanie plików / katalogów wyjściowych
• walltime - deklarowany czas trwania zadania

Format opisu zadań wraz z pełna listą dyrektyw QCG

Przykład opisu zadnia

#!/bin/bash 

#QCG host=zeus
#QCG queue=plgrid
#QCG walltime=PT5M

#QCG output=${JOB_ID}.output
#QCG error=${JOB_ID}.error

#QCG stage-in-file=input.txt -> lower.txt

cat lower.txt | tr "[:lower:]" "[:upper:]" > upper.txt
echo "Liczba znakow: " `wc -m upper.txt`
sleep 120
echo "Koniec: " `date`

#QCG stage-out-file=upper.txt -> ${JOB_ID}.upper

• Zadanie zostanie wykonane na klastrze zeus (#QCG host)
• Zlecone zostanie do kolejki "plgrid" (#QCG queue)
• Deklarowany czas działanie zadania to 5 minut (#QCG walltime)
• Standardowe wyjście (stdout) przegrane zostanie do katalogu, z którego zlecone zostało zadnie do pliku o nazwie będącej identyfikatorem zadania z rozszerzeniem "output".
• Standardowe wyjście błędów (stderr) przegrane zostanie do katalogu, z którego zlecone zostało zadnie do pliku o nazwie będącej identyfikatorem zadania z rozszerzeniem "error".
• Plik "input.txt", z katalogu, z którego zlecono zadanie przekopiowany zostanie do katalogu roboczego zadania pod nazwę "lower.txt".
• Zawartość pliku "lower.txt" poddana zostanie konwersji "do dużych liter". Wynik zapisany zostanie w pliku "upper.txt".
• Na standardowe wyjście zapisana zostanie informacja o liczbie znaków w pliku "upper.txt"
• Wykonanie programu wstrzymane zostanie na 120 sekund. (Potrzebne aby dać czas na wyświetlenie zadania i anulowanie go).
• Plik "upper.txt" przegrany zostanie do katalogu, z którego zlecone zostało zadanie pod nazwę identyfikator_zadania.upper.
  
  

Zlecenie zadania

Do zlecenia zadania do wykonania w infrastrukturze PL-Grid służy polecenie qcg-sub.

Zlecenie zadnia interaktywnego

Informacja o zadaniach

Anulowanie zadania