QCG Simple jest zbiorem prostych narzędzi wzorowanych na poleceniach systemów kolejkowych umożliwiających zlecanie i kontrolowanie zadań w infrastrukturze PL Grid. |
|
Opis zadania
Każde z zadań opisywane jest przy pomocy wykonywalnego pliku tekstowego zawierającego dyrektywy QCG.
Dyrektywy QCG mają charakter informacyjny dla systemu i dostarczają informacji jak przygotować środowisko wykonania dla danego zadania (pliki wejściowe/wyjściowe) oraz jakie są prefrencje/wymagania zasobowe.
Najprostszym plikiem zadania jest plik zawierający tylko informacje jak uruchomić daną aplikację:
W większości przypadków zadanie wymaga przekazanie do systemu dodatkowych informacji dotyczących konfiguracji środowiska wykonawczego bądź wymagań zasobowych.
Przekazanie tych informacji polega na umieszczeniu w pliku odpowiednich dyrektyw. Dyrektywy zaczynają się od sekwencji "#QCG", po ktorej następuje nazwa dyrektywy i opcjonalne parametry.
Najczęsciej wykorzystywane dyrektywy
Format opisu zadań wraz z pełna listą dyrektyw QCG
Przykład opisu zadnia
#!/bin/bash
#QCG host=zeus
#QCG queue=plgrid
#QCG walltime=PT5M
#QCG output=${JOB_ID}.output
#QCG error=${JOB_ID}.error
#QCG stage-in-file=input.txt -> lower.txt
cat lower.txt | tr "[:lower:]" "[:upper:]" > upper.txt
echo "Liczba znakow: " `wc -m upper.txt`
sleep 120
echo "Koniec: " `date`
#QCG stage-out-file=upper.txt -> ${JOB_ID}.upper |
- Zadanie zostanie wykonane na klastrze zeus (#QCG host)
- Zlecone zostanie do kolejki "plgrid" (#QCG queue)
- Deklarowany czas działanie zadania to 5 minut (#QCG walltime)
- Standardowe wyjście (stdout) przegrane zostanie do katalogu, z którego zlecone zostało zadnie do pliku o nazwie będącej identyfikatorem zadania z rozszerzeniem "output".
- Standardowe wyjście błędów (stderr) przegrane zostanie do katalogu, z którego zlecone zostało zadnie do pliku o nazwie będącej identyfikatorem zadania z rozszerzeniem "error".
- Plik "input.txt", z katalogu, z którego zlecono zadanie przekopiowany zostanie do katalogu roboczego zadania pod nazwę "lower.txt".
- Zawartość pliku "lower.txt" poddana zostanie konwersji "do dużych liter". Wynik zapisany zostanie w pliku "upper.txt".
- Na standardowe wyjście zapisana zostanie informacja o liczbie znaków w pliku "upper.txt"
- Wykonanie programu wstrzymane zostanie na 120 sekund. (Potrzebne aby dać czas na wyświetlenie zadania i anulowanie go).
- Plik "upper.txt" przegrany zostanie do katalogu, z którego zlecone zostało zadanie pod nazwę identyfikator_zadania.upper.
Zlecenie zadania
Do zlecenia zadania do wykonania w infrastrukturze PL-Grid służy polecenie qcg-sub.
Zlecenie zadnia interaktywnego
Informacja o zadaniach
Anulowanie zadania