Versions Compared

Old Version 1

changes.mady.by.user Unknown User (plgfilocha)

Saved on

compared with

New Version Current

changes.mady.by.user Łukasz Kitowski

Saved on

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

Krótki opis usługi

Usługa CVMFS udostępnia katalogi oprogramowania i danych potrzebnych do rekonstrukcji i analizy danych w eksperymentach HEP. Usługa działa na wydzielonych serwerach na zasadzie instalacji wirtualnego systemu plików CERNVM-FS dostępnego tylko do odczytu i montowanego przez moduł FUSE w lokalnej przestrzeni użytkownika. Katalogi tego systemu w ścieżce /cvmfs są następnie eksportowane przy pomocy protokołu NFS do maszyn dostępowych i maszyn roboczych. Pliki oprogramowania eksperymentów są udostępniane przez centralne serwery, a system plików CERNVM-FS stale synchronizuje z nimi zawartość lokalnych katalogów, w których pliki są sprowadzane fizycznie tylko przy próbie dostępu. W ten sposób są dostępne natychmiast wszystkie wersje oprogramowania i wszelkie modyfikacje wprowadzane na serwerach centralnych przy oszczędnym zużyciu lokalnych zasobów dyskowych. Obecnie dostępne jest oprogramowanie 4 eksperymentów na akceleratorze LHC, ALICE, ATLAS, CMS, LHCb, jednak zestawy dostępnych katalogów oprogramowania mogą się różnić w poszczególnych ośrodkach obliczeniowych.

Aktywowanie usługi

Katalogi CVMFS są dostępne w ośrodkach obliczeniowych PLGrid wspierających eksperymenty HEP. Aby móc korzystać z usługi należy mieć założone konto w Portalu PL-Grid i aktywować usługi:

  1. Dostęp do klastra w ośrodku obliczeniowym
  2. Dostęp do UI w ośrodku obliczeniowym
  3. Platforma dziedzinowa HEPGrid: usługa CVMFS

Usługi aktywuje się w Portalu Użytkownika, zgodnie z opisem.

Pierwsze kroki

Eksperyment ATLAS

  • Katalogi atlas.cern.ch,atlas-condb.cern.ch

  • Na WN dostępna jest zmienna środowiska VO_ATLAS_SW_DIR=/cvmfs/atlas.cern.ch/repo/sw

  • Pełną inicjalizację środowiska eksperymentu najprościej można wykonac przy pomocy pakietu ATLASLocalRootBase:
    • w pliku inicjalizacji powłoki, np. .bashrc:
      export ATLAS_LOCAL_ROOT_BASE=/cvmfs/atlas.cern.ch/repo/ATLASLocalRootBase
      alias setupATLAS='source ${ATLAS_LOCAL_ROOT_BASE}/user/atlasLocalSetup.sh'
    • w linii poleceń wykonujemy:
      setupATLAS
    • otrzymujemy zestaw poleceń ustawiających środowisko poszczególnych narzędzi i pakietów oprogramowanie

      Image Added
  • Wykonywanie zadań obliczeniowych w środowisku lokalnym i gridowym opisane jest na stronach https://twiki.cern.ch/twiki/bin/viewauth/AtlasComputing/WorkBook

Eksperyment LHCb

  • Katalog lhcb.cern.ch
  • Na WN dostępna jest zmienna środowiskowa VO_LHCB_SW_DIR=/cvmfs/lhcb.cern.ch
  • Środowisko obliczeniowe LHCb ustawiane jest poprzez zdefiniowanie dwóch zmiennych środowiskowych oraz wykonanie skryptu. Dla powłoki csh:
    • setenv MYSITEROOT $VO_LHCB_SW_DIR/lib
    • setenv CMTCONFIG x86_64-slc6-gcc46-opt
    • source $MYSITEROOT/LbLogin.csh

Zmienna CMTCONFIG określa wersje systemu operacyjnego oraz wersje gcc (w przykładzie zmienna określa SLC6, gcc 4.6 oraz wersje bibliotek z opcją kompilacji z optymalizacją)

Zaawansowane użycie

ATLAS

  • Przykład wykonywania zadań interakcyjne:
    inicjalizacja ATLASLocalRootBase przy pomocy poleceń opisanych wyżej i umieszczonych w pliku localrootbasecvmfssetup.sh

    Image Added

  • Przykład wysłania zadania obliczeniowego do kolejki lokalnej
    Image Added

Gdzie szukać dalszych informacji?

ATLAS CERNVM-FS: https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/AtlasComputing/CernVMFS

ATLAS pakiet inicjalizacji środowiska: https://twiki.atlas-canada.ca/bin/view/AtlasCanada/ATLASLocalRootBase

ATLAS praca w środkowisku gridowym: https://twiki.cern.ch/twiki/bin/viewauth/AtlasComputing/WorkBookStartingGrid

LHCb podręczniki do ustawiania środowiska i uruchamiania aplikacji do analizy danych https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/LHCb/DaVinciTutorial

LHCb praca w środkowisku gridowym: https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/LHCb/LHCbComputing#Distributed_Analysis_Ganga

Braki w dokumentacji prosimy zgłaszać w HelpDesk

Info

Poniższy szablon należy odpowiednio uzupełnić.

  • Układ należy zachować (z dopuszczeniem minimalnych modyfikacji).
  • Opis nie powinien przekraczać 10 stron przeciętnego ekranu laptopa.
  • W razie potrzeby należy założyć podstrony (na końcu z rozdziałem "Co dalej?" i odnośnikiem do kolejnego rozdziału dokumentacji).
  • Język opisu - polski. W sytuacji, gdy zasadnicza dokumentacja usługi ma być po angielsku, w tym rozdziale powinny znaleźć się podstawowe informacje pozwalające zorientować się w zaletach usługi i zgrubnie w wymaganych krokach do jej uruchomienia.
  • Uprawnienia do odczytu strony (Tools/Restrictions) mogą byś ustawione na "Confluence-users" w pisania dokumentacji, inaczej będzie widoczna od razu dla osób niezalogowanych.
  • Pytania dotyczące systemu dokumentacji: Hubert Siejkowski,
  • Pytania dotyczące Podręcznika Użytkownika: Unknown User (plgfilocha).
Info
Pomoc w pisaniu stron w Confluence: https://confluence.atlassian.com/display/DOC/Using+the+Editor

Krótki opis usługi

Dla kogo jest przeznaczona, jakie najważniejsze możliwości oferuje?

Aktywowanie usługi

Co należy aktywować, aby móc skorzystać z usługi? (Założenie konta, certyfikat, grant?, aktywacja konkretnych usług w portalu). Należy pamiętać o istnieniu rozdziałów ogólnych podręcznika, do których warto się odwołać.

Ograniczenia w korzystaniu (podsekcja opcjonalna)

Tutaj wpisujemy specjalne zasady korzystania z usługi jeśli takowe są np. konieczność ustawienia grantu domyślnego, zakaz uruchamiania intensywnych zadań na UI itp. Jeśli takowych nie ma to należy tę podsekcję usunąć.

Pierwsze kroki

Koniecznie z przykładowymi zrzutami ekranu lub fragmentami kodu.

Zaawansowane użycie

Ewentualnie jako osobny podrozdział.

Gdzie szukać dalszych informacji?

Strony zewnętrzne (jeśli są), odnośnik do helpdesku lub strony dokumentacji o pomocy.

...