Fizyka wysokich energii: CVMFS

Krótki opis usługi

Usługa CVMFS udostępnia katalogi oprogramowania i danych potrzebnych do rekonstrukcji i analizy danych w eksperymentach HEP. Usługa działa na wydzielonych serwerach na zasadzie instalacji wirtualnego systemu plików CERNVM-FS dostępnego tylko do odczytu i montowanego przez moduł FUSE w lokalnej przestrzeni użytkownika. Katalogi tego systemu w ścieżce /cvmfs są następnie eksportowane przy pomocy protokołu NFS do maszyn dostępowych i maszyn roboczych. Pliki oprogramowania eksperymentów są udostępniane przez centralne serwery, a system plików CERNVM-FS stale synchronizuje z nimi zawartość lokalnych katalogów, w których pliki są sprowadzane fizycznie tylko przy próbie dostępu. W ten sposób są dostępne natychmiast wszystkie wersje oprogramowania i wszelkie modyfikacje wprowadzane na serwerach centralnych przy oszczędnym zużyciu lokalnych zasobów dyskowych. Obecnie dostępne jest oprogramowanie 4 eksperymentów na akceleratorze LHC, ALICE, ATLAS, CMS, LHCb, jednak zestawy dostępnych katalogów oprogramowania mogą się różnić w poszczególnych ośrodkach obliczeniowych.

Aktywowanie usługi

Katalogi CVMFS są dostępne w ośrodkach obliczeniowych PLGrid wspierających eksperymenty HEP. Aby móc korzystać z usługi należy mieć założone konto w Portalu PL-Grid i aktywować usługi:

Dostęp do klastra w ośrodku obliczeniowym
Dostęp do UI w ośrodku obliczeniowym
Platforma dziedzinowa HEPGrid: usługa CVMFS

Usługi aktywuje się w Portalu Użytkownika, zgodnie z opisem.

Pierwsze kroki

Eksperyment ATLAS

Katalogi atlas.cern.ch,atlas-condb.cern.ch
Na WN dostępna jest zmienna środowiska VO_ATLAS_SW_DIR=/cvmfs/atlas.cern.ch/repo/sw
Pełną inicjalizację środowiska eksperymentu najprościej można wykonac przy pomocy pakietu ATLASLocalRootBase:
- w pliku inicjalizacji powłoki, np. .bashrc:
  export ATLAS_LOCAL_ROOT_BASE=/cvmfs/atlas.cern.ch/repo/ATLASLocalRootBase
  alias setupATLAS='source ${ATLAS_LOCAL_ROOT_BASE}/user/atlasLocalSetup.sh'
- w linii poleceń wykonujemy:
  setupATLAS
- otrzymujemy zestaw poleceń ustawiających środowisko poszczególnych narzędzi i pakietów oprogramowanie
Wykonywanie zadań obliczeniowych w środowisku lokalnym i gridowym opisane jest na stronach https://twiki.cern.ch/twiki/bin/viewauth/AtlasComputing/WorkBook

Eksperyment LHCb

Katalog lhcb.cern.ch
Na WN dostępna jest zmienna środowiskowa VO_LHCB_SW_DIR=/cvmfs/lhcb.cern.ch
Środowisko obliczeniowe LHCb ustawiane jest poprzez zdefiniowanie dwóch zmiennych środowiskowych oraz wykonanie skryptu. Dla powłoki csh:
- setenv MYSITEROOT $VO_LHCB_SW_DIR/lib
- setenv CMTCONFIG x86_64-slc6-gcc46-opt
- source $MYSITEROOT/LbLogin.csh

Zmienna CMTCONFIG określa wersje systemu operacyjnego oraz wersje gcc (w przykładzie zmienna określa SLC6, gcc 4.6 oraz wersje bibliotek z opcją kompilacji z optymalizacją)

Zaawansowane użycie

ATLAS

Przykład wykonywania zadań interakcyjne:
inicjalizacja ATLASLocalRootBase przy pomocy poleceń opisanych wyżej i umieszczonych w pliku localrootbasecvmfssetup.sh
Przykład wysłania zadania obliczeniowego do kolejki lokalnej